گلاتیرامر استات ترکیبی از چهار اسید آمینه است که از نظر ساختار، مشابه پروتئین میلین میباشد؛ پروتئینی که یکی از اجزای اصلی غلاف میلین در سیستم اعصاب مرکزی است. این دارو با تغییر پاسخ سیستم ایمنی از حالت التهابی به حالت ضدالتهابی عمل میکند. مکانیسم دقیق اثر آن به طور کامل مشخص نیست، اما مطالعات نشان دادهاند که:
گلاتیرامر استات باعث افزایش فعالیت سلولهای T تنظیمی میشود که نقش مهارکننده در التهاب دارند. این دارو تولید سایتوکاینهای ضدالتهابی را افزایش داده و سایتوکاینهای التهابی را کاهش میدهد. در نتیجه، از حمله سلولهای ایمنی به میلین جلوگیری کرده و آسیب به بافت عصبی کاهش مییابد. به طور کلی، گلاتیرامر استات باعث کاهش التهاب، حفظ غلاف میلین و کاهش سرعت پیشرفت ام.اس. میشود، بدون اینکه موجب سرکوب کلی سیستم ایمنی گردد.