میگراتکس با اتصال به گیرندههای 5-HT 1B/1D در رگهای خونی داخل جمجمه و اعصاب حسی سیستم سهقلو (تریژمینال) عمل میکند. اثر درمانی آن شامل تنگ کردن رگهای خونی مغز و کاهش آزادسازی نوروپپتیدهای التهابی است، که در نتیجه شدت درد میگرن کاهش مییابد و به بیماران کمک میکند راحتتر با حمله میگرن مقابله کنند.